Беатрис Фернандес родилась в Пуэрто-Рико в 1964 году и в начале спортивной карьеры защищала цвета флага Пуэрто-Рико, став в 1983 году первой профессиональной спортсменкой в этой стране; впоследствии материально поддерживала Кристину Бранди, всю карьеру выступавшую как гражданка Пуэрто-Рико и занимавшую на пике карьеры 27 место в рейтинге WTA.

До перехода в профессионалы, во время учёбы в Клемсонском университете, была включена в символическую сборную спортсменов-любителей США.

С 1988 года Джиджи Фернандес выступает за сборную США в Кубке Федерации. За это время она одержала 23 победы (20 в парах и 3 в одиночном разряде) и потерпела всего три поражения (2 в парах и одно в одиночном разряде). Фернандес четырежды играла в финалах этого турнира, но только однажды (в 1990 году) сумела его завоевать, когда сборная США обыграла в финале советскую команду. Остальные три раза Фернандес и её команда уступали в финале испанкам.

За время карьеры Фернандес выиграла два турнира WTA в одиночном разряде и 69 в парах, в том числе 17 раз побеждала в турнирах Большого шлема, первый из которых (Открытый чемпионат США) выиграла в 1988 году.

Большинство своих побед Фернандес одержала в паре с Натальей Зверевой, с которой играла начиная с 1991 года. На Открытом чемпионате Франции 1992 года эта пара начала серию из шести подряд побед на турнирах Большого шлема; в результате Зверева и Фернандес стали одними из немногих обладательниц некалендарного Большого шлема в парном разряде. Всего же за 1993 год их пара выиграла 13 турниров, в том числе итоговый турнир года (второй раз они выиграли этот трофей год спустя).

Помимо успехов в паре со Зверевой, Джиджи Фернандес дважды побеждала на Олимпийских играх в паре со своей однофамилицей Мэри-Джо Фернандес. Первый раз они завоевали «золото» на Олимпиаде 1992 года в Барселоне, победив испанок Мартинес и Санчес 7—5, 2—6, 6—2,а затем успешно защитили свой титул на Олимпиаде-96 в Атланте, обыграв в финале чешскую пару Новотна—Сукова со счётом 7—6(6), 7—4.

Хотя в активе Джиджи Фернандес нет побед в смешанном парном разряде в турнирах Большого шлема, в 1995 году она в паре с Сирилом Суком трижды пробивалась в финалы этих турниров.

Джиджи Фернандес пять раз признавалась WTA лучшей теннисисткой года в парном разряде: один раз в паре с Новотной и четыре раза в паре со Зверевой. В 2010 году Зверева и Фернандес были включены в списки Международного зала теннисной славы[1].